Voilà plus de 64 ans que les rescapés du vaisseau « NCC-1701 » sont bloqués. Mais sous peu s’aligneront les planètes Terre, Mars, Mercure, Jupiter et Pluton, ainsi que le soleil, permettant un retour dans le futur par la création d’une « fenêtre temporelle ». Un problème se pose encore : nos héros ne sont plus en possession de toutes les sphères d’énergie : ces éléments vitaux dont la réunion est nécessaire pour enclencher le processus de distorsion pour un bon temporel. Ils entament une véritable course contre la montre pour les retrouver.